Последовательность работы с программой:
1. Введите пароль в поля "раз" и "ещё раз"(два раза необходимо ввести пароль, чтобы удостовериться, что нет ошибки ввода);
2. Выбирается метод шифровки (по умолчанию - ГОСТ);
3. Выбираются файл или помечается группа файлов (клавишой CTRL и правой кнопкой мышки);
4. Нажимается кнопка "Шифровать" или "Дешифровать".

Главное помнить, зашифрован или дешифрован ли файл, и сколько раз. Проверить это можно, кликнув два раза на файле или нажав Enter. Файл откроется в соответствующем приложении. Если там абракадабра, видимо файл зашифрован.

Методы шифровки используемые в программе довольно таки надежные. Но при желании, я думаю, их можно разшифровать в лабораториях ЦРУ или КГБ. Если ваши файлы не столь секретны, то можете смело пользоваться программой.